Kääpiöhamsteria tulee käsitellä mahdollisimman paljon ja säännöllisesti, että ne kesyyntyvät. Niitä ei kuitenkaan välttämättä kannata päästää juoksentelemaan lattialle, koska ne ovat niin vikkeliä, että hukkuvat pian. Jos huone on kuitenkin sellainen, ettei hamsteri "voi hävitä" ja pidät sitä koko ajan silmällä, voit päästää sen lattiallekin. Kääpiöhamstereita tulee kylvettää pari kertaa viikossa chinchillankylpyhiekassa. Se on välttämätöntä niiden turkin kunnossa pysymisen kannalta. Tarkoitukseen ei sovellu mikään muu kuin eläinkaupasta saatava chinchillankylpyhiekka. Vesi pitää vaihtaa päivittäin ja ruokakuppi pestä muutaman kerran viikossa. Hamsterin kynnet täytyy leikata aina välillä, kun ne kasvavat liian pitkiksi. Vpit laittaa häkkin parina päivässä viikossa kipon jossa on kylpyhiekkaa, ja antaa kipon olla siellä noin 20 minuuttia. Kylpyastiaa ei välttämättä tarvitse pitää hökissä koko aikaa. Hamsteri saa pidettyä hampaansa ja kyntensä sopivan mittaisina,kun sillä on jotakin kovaa häkissä. Esim. savinen kukkaruukku on oiva tapa pitää kynnet lyhyinä.
Joidenkin kääpiöhamsteri lajien kynnet kasvavat liian pitkiksi, jolloin niitä pitää leikata. Kynsien leikkaus onnistuu parhaiten teräväkärkisillä askartelusaksilla. Eläinlääkärissä myydään eläimille tarkoitettuja pieniä kynsisaksia, jotka soveltuvat kääpiöhamsterin kynsien leikkuuseen. Kääpiöhamsteri kannattaa pitää vapaasti kädellä ja napsia kynsiä lyhyemmäksi aina, kun siihen on hyvä tilaisuus. Varsinkin aloittelijoille kynsien leikkuu voi olla hankalaa. Kynsien laikkauksessa monet kasvattajat ja eläinkaupat auttavat, jos ilmenee ongelmia.